Πρωταθλητής στους συλλόγους στην ποδηλασία αναδείχθηκε ο Π.Ο. Όμιλος Χανίων Τάλως. Η ομάδα της Κρήτης κατέκτησε την πρώτη θέση και το 2020, συγκεντρώνοντας 7.406 β. αφήνοντας πίσω του στην 2η τον Π.Ο. Κρόνο Νίκαιας με 7.338 β. και στην τρίτη τον Π.Ο. Βόλου με 6.821 β.
Την πρώτη 6άδα συμπλήρωσαν ο Ροδήλιος Π.Ο. Ρόδου (6.153), ο Π.Γ.Σ. Λάρισας (4.357) και ο Π.Ο.Πατρών (3.745), σε σύνολο 90 σωματείων που πήραν βαθμολογία.
Η παραπάνω τελική βαθμολογία συλλόγων προέκυψε μετά την εισαγωγή των 683 εγκεκριμμένων φύλλων αγώνων δρόμου, πίστας, ορεινής ποδηλασίας και cyclo cross για το 2020.