Παρά το γεγονός ότι η Πολιτεία επιδότησε το νησί της Κιμώλου με πολλά εκατομμύρια ευρώ, για να κατασκευασθούν έργα κοινής ωφέλειας, όπως βιολογικός καθαρισμός (ΒΙΟΚΑ), χώρος υγειονομικής ταφής απορριμμάτων (ΧΥΤΑ), τα έργα αυτά είτε δεν ολοκληρώθηκαν ποτέ, είτε δεν λειτούργησαν λόγω κακοτεχνιών, είτε λειτούργησαν προσωρινά και μετά καταστράφηκαν.
Η μονάδα επεξεργασίας αστικών λυμάτων στην Κίμωλο είναι ένα από τα σκανδαλώδη έργα κοινής ωφέλειας, όπου έχουν κατασπαταληθεί πολλές εκατοντάδες χιλιάδες ευρώ, που από έτος 1994, έτος κατασκευής του έως σήμερα, λειτουργεί πλημμελώς και δεν έχει ωφελήσει καθόλου το νησί.
Ειδικότερα:
Το έργο από το 1996 ξεκίνησε τη δοκιμαστική λειτουργία του, αλλά χωρίς να έχουν κατασκευασθεί και να έχουν ολοκληρωθεί βασικά έργα απαραίτητα για την ορθή λειτουργία του ΒΙΟΚΑ, όπως προέβλεπε ο αρχικός σχεδιασμός της εγκατάστασης και είχαν αρχικά εγκριθεί από το ΥΠΕΧΩΔΕ. Για την ημιτελή αυτή κατασκευή του ΒΙΟΚΑ, ο εργολάβος πληρώθηκε από το κράτος συνολικά 205.000.000 εκατομμύρια δραχμές, αλλά έκτοτε έως και σήμερα ο ΒΙΟΚΑ λειτουργεί πλημμελώς, χωρίς να τηρεί τους όρους και τις προϋποθέσεις που απαιτούνται από την κείμενη περιβαλλοντική νομοθεσία. Το ημιτελές αυτό έργο παρελήφθη παράνομα/παράτυπα έπειτα από 12 χρόνια, δηλαδή το 2008, από τον σημερινό δήμαρχο Θ.Γ. Μαγκανιώτη και από την Επιτροπή παραλαβής του Τμήματος Τεχνικών Υπηρεσιών Μήλου, δεδομένου ότι τα προγενέστερα Κοινοτικά Συμβούλια αρνήθηκαν να προβούν στην παραλαβή του έργου και καταγγέλλουν τη μη ολοκλήρωσή του, την πλημμελή κατασκευή του και τη μη νομότυπη παράδοσή του.
Εκτός των βασικών έργων αντι-ρύπανσης που δεν κατασκευάσθηκαν ποτέ, δεν έχουν εκδοθεί έως και σήμερα οι σχετικές αδειοδοτήσεις που απαιτούνται από τη νομοθεσία και δεν τηρούνται οι εγκεκριμένοι περιβαλλοντικοί όροι που έχουν τεθεί με την ΚΥΑ Α.Π. 3221/1994, ενώ επιθεωρητές περιβάλλοντος κατόπιν αυτοψίας τους βεβαίωσαν εννέα παραβάσεις της περιβαλλοντικής νομοθεσίας και εισηγήθηκαν πρόστιμο στον Δήμο Κιμώλου συνολικού ύψους 88.500 ευρώ. Το πρόστιμο επιβλήθηκε στον Δήμο Κιμώλου με απόφαση του γενικού γραμ. Περ. Ν. Αιγαίου.
Κατόπιν των ανωτέρω και ενώ ο ΒΙΟΚΑ δεν λειτουργούσε καθόλου, το έτος 2005, η πρώην Κοινότητα Κιμώλου προέβη σε ενέργειες κατασκευής αγωγού διάθεσης λυμάτων, συντάσσοντας μελέτες για την υλοποίηση του έργου κατασκευής. Το έργο εντάχθηκε σε προγράμματα χρηματοδότησης, ωστόσο απεντάχθηκε τρεις φορές λόγω παράνομων ενεργειών εκ μέρους της Κοινότητας.
Η κατασκευή του έργου αυτού περιελάμβανε το χερσαίο τμήμα μήκους 1.000 μέτρων και το υποθαλάσσιο τμήμα μήκους 500 μέτρων, συνολικής δαπάνης ύψους 1.500.000 ευρώ και η (πρώην) Κοινότητα Κιμώλου αποστέλλει προς το Τμήμα Τεχνικών Έργων Μήλου (πρώην ΤΥΔΚ Μήλου) το με Α.Π.929/7-06-2005 έγγραφο, στο οποίο δηλώνει ότι έχει εξασφαλισθεί η προφορική συναίνεση των ιδιοκτητών όπου θα διέλθει ο αγωγός διάθεσης λυμάτων, γεγονός απολύτως ψευδές.
Ακολούθως (η πρώην ΤΥΔΚ) το σημερινό ΤΤΕ Μήλου, ως μόνιμος συνεργός αλλά και ως σήμερα υποστηρικτής όλων των παρανομιών/παρατυπιών που διενεργούνται από την Κοινότητα και τον σημερινό δήμαρχο Κιμώλου, δεν ενημερώνει -ως όφειλε- τους φορείς λειτουργίας του ΒΙΟΚΑ, ότι δεν ισχύει η προφορική συναίνεση, αλλά βάσει της νομοθεσίας απαιτείται να εξασφαλισθεί η έγγραφη συναίνεση των ιδιοκτητών όπου θα διέλθει ο αγωγός διάθεσης λυμάτων.
Παρότι το ΤΤΕ Μήλου είναι υπεύθυνο για τα τεχνικά έργα των δήμων και κοινοτήτων, καθότι γνωρίζει τη νομοθεσία που διέπει ανάλογα έργα, δεν τηρούνται οι νόμιμες διαδικασίες από τους δημόσιους λειτουργούς και παραβαίνουν τα καθήκοντά τους, ενώ προβαίνουν αυθαίρετα και παράνομα στις διαδικασίες για τη σύνταξη μελετών για την κατασκευή του αγωγού διάθεσης χωρίς τις νόμιμες προϋποθέσεις.
Ο υποψήφιος βουλευτής Κυκλάδων των Ανεξάρτητων Ελλήνων – Άρμα Πολιτών, Νίκος Λογοθέτης, με νεότερη καταγγελία του επανέρχεται στο έργο του Βιολογικού Καθαρισμού Κιμώλου.
Συγκεκριμένα, υποστηρίζει ότι η κατασκευή του αγωγού διάθεσης λυμάτων είναι παράνομη, ενώ καταγγέλλει τον δήμαρχο Κιμώλου, τον προϊστάμενο της Πολεοδομίας Μήλου και την υπεύθυνη Τεχνικών Έργων Μήλου για άμεση εμπλοκή στο σκάνδαλο με σκοπό την αρπαγή 1,5 εκατ. ευρώ και την κατασπατάληση δημοσίου χρήματος.